青パパイヤには血流改善が期待できるポリフェノール、ストレスを緩和させるGABAなど様々な機能性成分が入っている。パパイヤにしかないカルパインは抗菌・抗ウイルス活性を示す。マラリアやデング熱などにも効果あるという。カルパインは青パパイヤのときには蓄積しているが完熟パパイヤになると減少する。