明確に地域差がみられる縄文人らしさが地域による体質の違いを生み出していた。お酒の強さの地域性も縄文人遺伝子の影響。お酒が弱い遺伝子変異は世界的にみても揚子江下流域に集中。関西や中国地方にお酒が弱い人が多いのはこの地域に大陸から多くの人が流入したことと関連している可能性があるという。また、BMIの高さを県別でみると、特に女性では縄文人度合いの地図とシンクロして東北が高めの数値になっている。逆に、縄文度合いが低い人はアレルギーや喘息が多くみられるという。