JR東日本によると29日午後10時半頃、秋田新幹線が同じ線路を利用するJR田沢湖線・刺巻駅〜JR奥羽本線・神宮寺駅間で停電が発生。回送列車のパンタグラフが何かに衝突したためとみられており、ケガ人は出ていない。この影響で29日夜、東京発秋田行「こまち43号」「こまち45号」が秋田県内の最寄駅に停車し、乗客230人が車内で夜を明かした。その後、乗客はバスやタクシーなどで代替輸送されている。秋田新幹線は30日も午前10時台まで盛岡駅〜秋田駅間で運休が続いたが、10時半過ぎに運転を再開した。