大学院生の佐藤枢は婚約者の高橋栞織と初詣に訪れていた。帰り道、枢は交通事故で意識不明の重体に。奇跡的に意識を取り戻したが、リハビリの中でスーパーコンピューター並の計算能力を発揮。さらに5日間で5カ国以上の言語をマスター。主治医の三枝摩耶によると、脳がダメージを受けた部分の機能を補おうとした結果、一部が活性化され、圧倒的な知能を発揮したという。三枝は栞織に圧倒的な知性を持った枢は人格そのものが生まれ変わったと伝える。それでも栞織は枢のことを諦めずにいた。脳神経外科医の三枝にとって枢は研究対象だった。しかし三枝は枢の能力に陶酔するようになる。一方、栞織は枢の超人的な知能に戸惑いつつも、事故以前と変わらぬ優しい枢が戻ってきたと思うようになっていた。しかしある日、多額の金を要求してくる父親について、枢に話したところ、数日後父親が放火で亡くなったことを知る。その時、枢のパソコンに灯油の注文履歴と父のアパートの地図が表示されているのを見てしまう。放火犯は捕まったが、栞織は枢が超人的な知能で犯人を操ったのではと疑う。退院した枢の新古は三枝が手配していた。新居にはスーパーコンピューターが何台も揃えられていた。そこで枢の知性は人の枠を超え、神の領域に近づくかのように邪魔者を次々排除し、世界を混乱に落とし入れていく。それでも栞織は最後まで諦めず枢の心にうったえていく。