抗生物質が効かない薬剤耐性菌は患者への抗生物質の過剰な処方や体内に菌が残っているのに服薬をやめてしまう中途半端な使用などにより増加しているとされ、国内外で深刻な問題となっている。北海道大学などの研究グループは薬剤耐性菌の中でも特に耐性の強い大腸菌ST131について、2021年までの6年間に岐阜県や滋賀県などで摂取したタヌキやシカなど野生動物のフンや川や湖の水と同じ地域に住む人の尿からそれぞれ検出し全ての遺伝情報を調べた。その結果、分析した遺伝子の99．3％が一致していたことから、グループでは薬剤耐性菌が人から自然環境に広がっている可能性があるとしている。こうした薬剤耐性菌の広がりを遺伝情報のレベルで明らかにしたのは国内初で、グループはこのまま対策が取られなければ自然環境に薬剤耐性菌がさらに広がり、逆に動物から人に循環することで新たな感染症を引き起こす恐もあると指摘している。