JRは特急列車など計391本が運休となっており、快速エアポートなども通常より本数を減らしている。特急列車は16本が運休。函館線、根室線、宗谷線、石北線、釧網線では運転を見合わせる区間がある。午前6時半頃から午前8時半頃までJR北海道公式ホームページの中の列車運行情報がつながりにくい状態になった。新千歳空港では計99便の欠航が決まっている。