熊本市中央区にある熊本城ホールでは、エレベーター内に12人が閉じ込められているという。熊本市電は全線で運転を見合わせていて、最寄りの電停で降りたい人は下車しているが、車両内の空調は使えるため数人が車両の中に留まっている。熊本城では来場者や職員の無事は確認されているが被害の有無についてはこれから確認する。東京大学地震研究所名誉教授・笠原順三の解説。有感地震が長く続くのではないか。震度が浅いのでマグニチュード4くらいでも震度4～5に達する可能性がある。

熊本市内では最大震度6強を観測。総務省消防庁によるとイオンモール熊本で爆発があり2階部分が崩落し閉じ込められた人が多数いて消防が救出を急いでいるという。イオンは爆発の詳しい時刻は分かっていないとしている。地震直後に従業員と来店客を施設の外に待避させたという。機材の搬入口が特に爆発の被害が大きく、幹線道路まで破片が散乱していて車が通行できない状況になっている。