「東洋文庫ミュージアム」はアジア全域の歴史や文化の本を扱う研究図書館。国宝5点・重要文化財7点を含む約100万点の書籍や資料を所蔵している。モリソン書庫はG.E.モリソン博士が集めた約2万4000点の蔵書が並ぶ。岩崎久彌がモリソン博士の蔵書を購入したことが東洋文庫設立のきっかけとなった。現在企画展「世界図ってなんだ！？ －地図が語る世界－」を開催中。
併設の「オリエント・カフェ」ではマリー・アントワネットが所有したといわれるイエズス会士書簡集をモチーフにしたお重ランチ「マリー・アントワネット」が楽しめる。料理にはカフェの母体である小岩井農場の牛肉や乳製品などを使用。