深大寺の山門は江戸時代の1695年に建てられた。お寺の参拝作法は「手水で手を清める」「線香をあげその煙で身を清める」「合掌でお参り」。1865年の火災で山門・常香楼以外は焼失したし、常香楼には今も江戸時代の焼け跡が残っている。本堂は大正7年に再建。
深大寺に祀られている東日本最古の国宝は飛鳥時代に制作された釈迦如来像。深大寺ができた奈良時代に持ち込まれたと伝えられている。火災で焼けた跡が残っているが奇跡的にほとんどそのままの状態で残っている。当時の最先端技術で作られた国家レベルの作品。深大寺の開祖・満功上人の兄弟・高麗福信が奈良時代に釈迦如来像を譲り受け深大寺に贈ったと推察されている。