豊臣秀吉のもと、九鬼嘉隆は鳥羽の海賊から大名へ出世した。一方、海賊行為を繰り返していた村上海賊は瀬戸内海から追放された。秀吉は朝鮮出兵に踏み切ると、九鬼水軍は造船を命じられることとなり、過酷なノルマを課されたという。秀吉の薨去によって、朝鮮での戦は幕を閉じた。不要となった軍船は解体され、 関ヶ原の戦いの際に九鬼嘉隆は西軍、子息は東軍につく。西軍敗走の知らせが舞い込むと、九鬼嘉隆は切腹し果てた。1633年、九鬼家は分裂し、鳥羽から内陸部に領地替えを命じられた。