箱根神社の隣には芦ノ湖の守護神・九頭龍大神をお祀りする「九頭龍神社」がある。商売繁盛などにご利益があるとされている。実は箱根神社の隣りにあるのは1999年に建てられた「新宮」。「本宮」は芦ノ湖畔に鎮座し、参拝するには箱根神社から20～30分歩くことになるが、毎月13日の「月次祭」の時限定で「大茶会」など臨時運航の遊覧船で参拝に行ける。