近年、JICA・日本企業・ペルー政府が共同で調査を進めている。ドローンに載せたレーザーなどで遺跡を詳細に計測し3Dデータとして記録している。ワイナピチュの裏側に広がる深い森にはまだ知られていない遺跡があると言われている。ドローンに載せたレーザーなどで地形を解析すると、木々の下に隠れた地表が浮かび上がってきた。地表の様子を見ると輪郭のようなものが見えた。新発見の遺跡ではないかという。