上皇ご夫妻は1994年2月12日硫黄島を訪問した。遺骨の未収集は国内外に約112万柱ある。1995年7月26日長崎を訪問し翌日広島を訪問した。8月2日沖縄を訪問し国立沖縄戦没者墓苑で花を手向けた。翌日東京大空襲の犠牲者を慰霊した。沖縄慰霊の日・広島・長崎原爆の日・終戦の日を忘れてはならない4つの日として黙祷されてきた。2015年6月27~28日サイパンを訪問し通称「バンザイ・クリフ」で慰霊をした。2015年4月8~9日パラオを訪問し白い菊の花を手向けた。2016年1月26~30日フィリピンを訪問し墓地で2分近く頭を下げた。