耐性菌とは、いわゆる細菌が抗生物質に抵抗を持つために変容したもの。細菌の主な病気は、百日せき・マイコプラズマ肺炎・中耳炎・膀胱炎・O-157など。特に日本では膀胱炎でも耐性菌が見付かってきていることも懸念されている。風邪やインフルエンザの原因の殆どはウイルスなので、抗生物質を服用することは基本的にはしてはいけないという。細菌の感染症は、特効薬が抗生薬・抗生物質なので、抗生物質を飲んでもなかなか効かないとなると耐性菌を疑わないとならないという。一度耐性になるとなかなかもとに戻りにくいので、耐性菌による感染が広がったら耐性菌感染症が広がっていくという。そのため、何らかの形で抗生物質をうまく使いながら耐性菌を抑制していく形をとっていかないとならないという。インフルエンザは生存のために常に変異を繰り返していくが、耐性菌は抗菌薬に対して耐性変異したものなので後天的なものだという。通常百日せきと診断を受けると、第一次選択薬が処方される。服用してもなかなか良くならない場合は耐性菌を疑う必要があり、もう一度検査をする必要があるという。滞在菌を増やさないためには、処方された抗菌薬を飲み切ること。途中でやめると耐性菌が出てくるという。耐性菌に対する抗生物質の開発もしているが、抗菌薬の開発がここ30年停滞しているという。開発には莫大な費用と時間がかかり、見合ったリターンが得られないからだという。