フリースクールに通う子どもたちは地域の小学校に籍を置きながら、通っている。学校長が認めれば出席としてカウントされるケースもある。フリースクールの課題はお金の事。家庭が負担するフリースクールの利用料金は全国平均で月に3万3000円で利用できる補助金ない。徳島県も子どもの孤立対策への援助は検討しているがフリースクールへの具体的な支援はまだ決まっていない。もう1つの課題は作るのに特別な資格や基準がないことだった。長野県では昨年フリースクールの認証制度を導入し財政支援を行うという方針を打ち出していま検討が進んでいる。