羽田空港でも一部でシステムトラブルが起きている。デルタ航空は、午後5時ごろから運航を停止。デルタ航空によると羽田空港だけでなく世界各地の空港からの出発便について運航を停止していて、欠航している便もあるという。他の航空会社でも遅れが出ていて、アメリカン航空のチェックインカウンターにも列ができている。日本航空では運航に支障は出ていないが、日本航空のウェブサイト上で国際線の航空券の予約や購入予約の確認ができないなどいったシステムトラブルが発生。全日空については、トラブルは起きていないという。