地震発生時刻の午後2時46分、各地で黙祷が捧げられた。74人が犠牲となった宮城県石巻市の大川小学校では、遺族らが当時のまま残された校舎で黙祷を捧げた。山林火災のあった岩手県大船渡市でも祈る人の姿があった。自宅が全焼した女性は、震災で亡くなった祖母について、火災で仏壇などもなく、心の中で手を合わせることしかできないなどと話した。阪神・淡路大震災から30年となった兵庫県や能登半島地震で被災した石川県の輪島市役所でも黙祷が捧げられた。東京・銀座でも多くの人が足を止めて祈りを捧げていた。